Sisälähetysseuran museo sijaitsee Sisälähetysseuran oppilaitoksen tiloissa lähellä Pieksämäen keskustaa. Sisäoppilaitoksen vanhimmat osat – päärakennus, entiset lastenkdin ja vanhainkodin rakennukset ja sairaala – on rakennettu 1950-luvun alussa Sortavalasta Pieksämäkeen siirtyneen seuran tarpeisiin. Nykyään museon omistaa Kirkkopalvelut ry, ja se on saanut uudet, remontoidut tilat oppilaitoksen päärakennuksesta vuonna 2007. Opastuksesta ja avoinnapidosta vastaavat vapaaehtoiset oppilaitoksen entiset työntekijät.

Sisälähetysseuran museon perustaminen ja kokoelmien kartuttaminen tehtiin vapaaehtoistyönä. Lehtori Katri Kuittinen ja hänen tukenaan ollut museotoimikunta keräsivät ja tallettivat oppilaitoksilta ja Koivurannan vanhainkodilta löytyneitä huonekaluja, esineitä, kirjoja ja valokuvia. Myös monet entiset sisaropiskelijat ja työntekijät lahjoittivat hallussaan olleita esineitä museolle. Kokoelmiin karttui yli 500 esinettä, ja museo avattiin yleisölle vuonna 1989.

Museon uudessa perusnäyttelyssä esitellään sisälähetysseuran oppilaitosten ja opetustoiminnan historiaa. Esillä on kirkon sosiaalialan toimintaan ja koulutukseen – niin sairaanhoitoon, diakoniatyöhön sekä lapsi-, vanhus- ja vammaishuoltoon kuin päihdekuntoutukseen – liittyvää esineistöä. Esimerkiksi erilaisia työ- ja oppilaspukuja ja oppikirjoja on useiden vuosikymmenten varrelta.